Se han identificado algunas problemáticas derivadas del uso desmesurado de agrotóxicos. Una de las  que más se destacan en este aspecto, ha sido el riesgo al que se expone el agricultor al no utilizar adecuadamente los implementos de protección personal (EPP), cuando utilizan productos como plaguicidas, insecticidas, herbicidas y fungicidas, pues su salud queda expuesta a enfermedades e intoxicación. Es importante mencionar que muchas veces el agricultor no es consciente del riesgo al que se expone, esto puede ser debido a la falta de información y hábitos en pro de su autocuidado. Dado lo anterior, Bejarano (2011), menciona algunos efectos negativos más comunes asumidos al uso de dichas sustancias, como lo son dolores de cabeza, náuseas, vómitos, dolores de estómago y diarreas. En este sentido otro problema emergente ha sido que el uso indiscriminado de estos químicos, afecta el suelo y ecosistemas de manera directa e indirecta.